Období od emigrace-1648:

Didaktika- česky psaná práce, jež byla návrhem jednotné a obecné školské soustavy.
Informatorium školy mateřské- obrací se k matkám a chůvám a upozorňuje na nenahraditelnost výchovy dítěte v rodině v předškolním věku.
Dveře jazyků otevřené- učebnice latiny
Velká didaktika (1657)- psáno latinsky, první systematické dílo o výchově a vzdělání, které je považováno za základ pedagogiky jakožto vědy
Základní myšlenky:
- v centru pozornosti je žák, nikoliv učitel
- vzdělání navrhuje Komenský rozdělit do 4 stupňů po 6 letech, škola mateřská, škola národní, škola latinská (gymnázia) a univerzita
- vzdělání má být dostupné pro všechny
- výuka má být přirozená a nenásilná
- výuka má směřovat k praktickým potřebám života
- ve výuce je třeba postupovat od jednoduchého ke složitějšímu